Desarrollo de un protocolo informático para el análisis genómico de organismos procariotas

Abstract

La bioinformática es una subdisciplina científica que se apoya en las ciencias de la computación para almacenar, analizar, visualizar y anotar información biológica como secuencias de ADN y proteínas. Este trabajo propone un protocolo informático para la realización de análisis biológicos que se enmarcan dentro de la genómica comparativa, específicamente para organismos procariotas. Se presentan apartados de computación para entender y usar instrucciones del sistema operativo GNU/Linux y formatos de archivo que se recomienda conocer para quienes deseen incursionar en la bioinformática. También se describen conceptos biológicos fundamentales para entender el análisis de este tipo de información: estructura del ADN, secuenciación; y un flujo de trabajo de genómica comparativa para realizar evaluación de los ensambles, anotación de genes, establecer relaciones filogenéticas y su interpretación. La generación de un árbol filogenético está incluida en la parte final. Además, este trabajo provee información actualizada y brinda un enfoque holístico de la bioinformática, aborda el protocolo propuesto desde la perspectiva biológica y computacional. De esta manera, la audiencia puede ser multidisciplinaria: a) personas con formación académica del área biológica que requieren fortalecer sus conocimientos en computación para implementar el protocolo propuesto y b) personas con formación en ciencias de la computación que requieren reforzar sus conocimientos biológicos para entender el resultado del análisis.