DSpace Repository

Análisis comparativo de la diversidad morfológica, patogénica y genética de Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis aisladas de México

Show simple item record

dc.provenance Universidad Autónoma de Sinaloa, Facultad de Agronomía, Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, Facultad de Ciencias del Mar, Facultad de Agricultura del Valle del Fuerte
dc.contributor.advisor Garzón Tiznado, José Antonio
dc.creator Márquez Zequera, Isidro
dc.date.accessioned 2024-08-22T17:19:23Z
dc.date.available 2024-08-22T17:19:23Z
dc.date.issued 2024-08
dc.identifier.uri http://repositorio.uas.edu.mx/jspui/handle/DGB_UAS/771
dc.description.abstract Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm) es un actinomiceto patógeno de plantas que causa el marchitamiento y el cáncer bacteriano del tomate (Solanum lycopersicum L.); es una bacteria difícil de controlar a nivel mundial y año con año causa grandes pérdidas económicas. El objetivo de la investigación fue determinar la variabilidad morfológica, patogénica y genética de cepas de Cmm colectadas en diferentes zonas productoras de tomate en México, para lo cual se llevó a cabo un estudio de tipo descriptivo durante el periodo de septiembre de 2019 a agosto de 2023, que incluyó el análisis comparativo de 60 cepas de Cmm considerando características de color, mucosidad y tamaño de colonia; así como, la presencia/ausencia de los genes relacionados a la capacidad patogénica de la bacteria como: celA, pat-1, Chpc, ppaA, y tomA; además del gen altamente conservado 16S, encontrando escasa diferencia en cuanto a genes de patogenicidad, pero una gran variabilidad en características morfológicas y en el análisis filogenético del gen 16S. La capacidad patogénica de la bacteria también fue analizada donde se inocularon además de tomate, otras plantas solanáceas como: petunias, papa, berenjena, chile y tabaco; encontrando que, la bacteria tiene la capacidad de reproducirse en todas ellas; sin embargo, ésta puede o no ocasionar síntomas, lo último observado en berenjena y tabaco, por lo que se sugiere que la tasa de replicación de la bacteria se mantiene en niveles bajos como para no ocasionar daño. Finalmente, se llevó a cabo la secuenciación de los genomas de cinco cepas de Cmm clasificadas en base a su virulencia desde muy baja a muy alta y se realizó un análisis bioinformático genómico comparativo con el programa Geneious y el algoritmo MAUVE progressive. Se obtuvieron para las cinco cepas las secuencias de un cromosoma y dos plásmidos que mostraron una alta similitud en tamaño y contenido de GC. A nivel de cromosoma se observó una zona altamente variable entre cepas y que codifican para enzimas relacionadas al metabolismo celular y de respuesta a condiciones adversas. Lo anterior pudiera estar relacionado con las diferencias observadas en las cinco cepas en cuanto a virulencia. Se observó también alta variabilidad en la secuencia pCM2U de la cepa CMM09 altamente virulenta con respecto a las otras y escasa variabilidad en las secuencias del plásmido pCM1. Debido a lo anterior, se recomienda analizar la expresión directa de estos genes diferenciales para corroborar su función en la virulencia de la bacteria. es_MX
dc.language spa
dc.publisher Universidad Autónoma de Sinaloa
dc.rights OpenAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.subject Genoma es_MX
dc.subject Cromosoma es_MX
dc.subject Plásmidos es_MX
dc.subject Genes de patogenicidad es_MX
dc.subject Secuenciación es_MX
dc.subject.classification Ciencias Agropecuarias
dc.title Análisis comparativo de la diversidad morfológica, patogénica y genética de Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis aisladas de México es_MX
dc.type Tesis Doctorado
dcterms.contributor Garzón Tiznado, José Antonio::orcid::0000-0003-0423-3349::role::asesorTesis es_MX
dcterms.creator Márquez Zequera, Isidro::orcid::0000-0003-4660-5032 es_MX
dc.degree.grantor Universidad Autónoma de Sinaloa
dc.degree.department Facultad de Agronomía
dc.degree.department Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia
dc.degree.department Facultad de Ciencias del Mar
dc.degree.department Facultad de Agricultura del Valle del Fuerte
dc.degree.postgraduate Doctorado en Ciencias Agropecuarias
dc.degree.name Doctorado en Ciencias Agropecuarias
dc.degree.level Doctorado
dc.description.repository Repositorio Institucional Buelna. http://repositorio.uas.edu.mx/jspui/ Universidad Autónoma de Sinaloa. Dirección General de Bibliotecas
dc.rights.accessrights Acceso abierto
dc.audience Público en general
dc.publisher.location MX
dc.degree.zone Unidad Regional Centro


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

OpenAccess Except where otherwise noted, this item's license is described as OpenAccess